Федеральный закон РФ от 21.11.1996 г. № 129-ФЗ (в ред. от 30.06.2003 г.) «О бухгалтерском учете» не освобождает организации, осуществляющие предпринимательскую деятельность, подлежащую налогообложению единым налогом на вмененный доход для отдельных видов деятельности, от обязанности ведения бухгалтерского учета. Минфин в своих письмах подчеркивает необходимость ведения бухгалтерского учета в организациях, переведенных на ЕНВД (письмо Минфина РФ от 16.12.2005 г № 03-11-04/2/156) .
Согласно статье 23 НК РФ налогоплательщик обязан представлять в налоговый орган по месту учета в установленном порядке также бухгалтерскую отчетность в соответствии с Федеральным законом «О бухгалтерском учете». В статье 13 этого Закона приведен состав бухгалтерской отчетности, куда входит, в том числе и баланс.
Таким образом, аптека, переведенная на ЕНВД, должна вести в полном объеме бухгалтерский учет в соответствии с установленными законодательством правилами и представлять в налоговые органы бухгалтерскую отчетность.
Кроме того, нормы законодательства об обществах с ограниченной ответственностью (пункт 3 статьи 91 ГК РФ, статьи 18, 23, 25, 26, 45, 46 Федерального закона РФ от 08.02.98 г. № 14-ФЗ «Об обществах с ограниченной ответственностью» (в ред. от 29.12.2004 г.)) обязывают общество с ограниченной ответственностью вести бухгалтерский учет и составлять бухгалтерскую отчетность общества, а также утверждать распределение прибылей и убытков.